Las colecciones del Museo Histórico Nacional se componen de diferentes objetos, que a través de sus materialidades, técnicas, usos sociales, propietarios y/o contextos permiten construir relatos sobre la historia nacional.
Estas piezas poseen distintos orígenes, tales como: proyectos museales efímeros, como fue el Museo Militar o de los arsenales de guerra; instituciones como el Museo Nacional de Bellas Artes y el Museo Nacional de Historia Natural; las primeras exposiciones de carácter histórico como las del Coloniaje (1873), del cerro Santa Lucía (1874) y del Centenario (1910); los salones de arte; colecciones privadas; y las donaciones o legados realizados por diferentes personas desde el siglo XIX hasta la actualidad.
A lo largo de su historia, el Museo ha trabajado en el acopio, conservación, investigación y difusión de este patrimonio.
Las colecciones del Museo se han agrupado de la siguiente manera:
Colección de Artes Decorativas y Escultura
Colección de Artes Populares y Artesanía
Colección de Pintura y Estampas
Colección de Textil y Vestuario
Colección de Arqueología y Etnografía
Colección de Herramientas, Equipos e Instrumentos
Colección de Numismática y Medallas
Colección de Libros y Documentos
Colección de Armas y Armamentos
